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Dernière mise à jour : Mai 2021

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UMR SILVA

Microscope à microdissection laser

Microscope à microdissection laser
Silvatech-microdissection-laser

1. C’est quoi ?

Un microscope optique équipé d’un faisceau laser concentré pour découper et isoler un échantillon d’intérêt à l’échelle micrométrique.

2. A quoi ça sert ?

Le microscope à microdissection laser permet l’obtention de microéchantillons dédiés à l’analyse du transcriptome à l’échelle cellulaire. Le PALM Microbeam emploie un faisceau laser concentré pour découper et isoler l’échantillon d’intérêt à l’échelle du micromètre. La catapulte laser permet ensuite d’isoler la zone cible rapidement et sans contamination. Les ARN des échantillons ainsi capturés peuvent ensuite être obtenus grâce à des protocoles spécifiques puis analysés par PCR quantitative ou RNAseq. D’autres applications sont envisageables : métabolomique , protéomique,  isolat de microorganismes, isolation de cellules uniques pour la génomique… toutefois ces applications n’ont pas encore été développées dans le laboratoire.

3. Quelles thématiques /applications ?

Etudes transcriptomiques de tissus infectés par un pathogène, de la symbiose mycorrhizienne, de processus physiologiques à l’échelle cellulaire, de tissus du bois…

Articles de référence :

  • Hacquard et. al. 2010 Laser Capture Microdissection of Uredinia Formed by Melampsora larici-populina Revealed a Transcriptional Switch Between Biotrophy and Sporulation. MPMI 2010 23:10, 1275-1286
  • Hacquard et al. 2013. Functional heterogeneity within ectomycorrhizas. Environ Microbiol, 15: 1853-1869.  https://doi.org/10.1111/1462-2920.12080
  • Durand et a. 2020. Element content and expression of genes of interest in guard cells are connected to spatiotemporal variations in stomatal conductance. Plant, Cell & Environment 43 (1), 87-102

 4. Qui contacter ?

Christophe Rose : christophe.rose@inrae.fr

 5. Pour aller plus loin / Documents à consulter

https://www.youtube.com/watch?v=Qs8onaLfq8c